このゲームは以下の機能が追加しています。

○PCM8による、一部効果音の多重化を選択可能
   ※オンメモリ化パッチの仕様により、さらに重くなっていますので、
     高クロックが必要になります。高クロックにすると、エンディングやゲームオーバー、
     ハリアーのやられたときのイベントなどで、バランスがおかしくなります。
○キャラクターエディタの追加
   ※本体ディスクはLZDSYS.Xで圧縮されているため本体ディスクにはセーブできません。
○X68000版アフターバーアーナー２のおまけに付属のマウスモードを選択可能
   ※メインメニューはキーボード操作になります。
○ディスプレイ31KHzモードで起動を選択可能
   ※タイミングやゲームスピードがおかしくなる場合があります。
○パッチを適用により、
  オンメモリ機能により、ステージ間のロードとキャラ展開の時間が無くなった。
  ゲーム中のグラフィック描画書換が早くなった。
  ステージスキップや無敵モード、連射モードの追加